Genomics and bioinformatics capacity in Africa: no continent is left behind

Genome. 2021 May;64(5):503-513. doi: 10.1139/gen-2020-0013. Epub 2021 Jan 12.

Abstract

Despite the poor genomics research capacity in Africa, efforts have been made to empower African scientists to get involved in genomics research, particularly that involving African populations. As part of the Human Heredity and Health in Africa (H3Africa) Consortium, an initiative was set to make genomics research in Africa an African endeavor and was developed through funding from the United States' National Institutes of Health Common Fund and the Wellcome Trust. H3Africa is intended to encourage a contemporary research approach by African investigators and to stimulate the study of genomic and environmental determinants of common diseases. The goal of these endeavors is to improve the health of African populations. To build capacity for bioinformatics and genomics research, organizations such as the African Society for Bioinformatics and Computational Biology have been established. In this article, we discuss the current status of the bioinformatics infrastructure in Africa as well as the training challenges and opportunities.

En dépit de la faible capacité en matière de recherche en génomique en Afrique, des efforts visant à habiliter les scientifiques africains à s’impliquer en recherche génomique, particulièrement celle visant des populations africaines, ont été faits. Le consortium “Human Heredity and Health in Africa (H3Africa)” est une initiative visant à faire de la recherche génomique en Afrique un travail véritablement africain et il a été mis sur pied grâce à un financement conjoint du United States’ National Institutes of Health Common Fund et du Wellcome Trust. H3Africa cherche à encourager l’emploi d’une approche contemporaine en recherche par des chercheurs africains et de stimuler l’étude des déterminants génomiques et environnementaux de maladies communes. Le but de ces efforts est d’améliorer la santé des populations africaines. Pour augmenter la capacité de recherche en matière de bioinformatique et de génomique, des organisations comme l’African Society for Bioinformatics and Computational Biology (Société africaine de bioinformatique et de biologie computationnelle) ont été mises sur pied. Dans cet article, les auteurs présentent l’état actuel de l’infrastructure bioinformatique en Afrique de même que les défis et opportunités en matière de formation. [Traduit par la Rédaction] , , , .

Keywords: Africa; Afrique; Uganda; bioinformatics; bioinformatique; genomics; génomique.

MeSH terms

  • Africa
  • Computational Biology*
  • Education
  • Education, Distance
  • Genome
  • Genomics* / education
  • Humans
  • Internet
  • Research
  • Uganda
  • Whole Genome Sequencing